LABORATORIJ ZA FENOTIPIZACIJU osnovan je 2019. godine kao rezultat rada na projektu Bioraznolikost i molekularno oplemenjivanje bilja koji se provodi u suradnji sa Znanstvenim centrom izvrsnosti za bioraznolikost i molekularno oplemenjivanje bilja (CropBioDiv), a financiran je iz Europskog fonda za regionalni razvoj (KK.01.1.01.005). Cilj laboratorija je uspostaviti visokopropusni sustav tehnika (metoda) fenotipizacije koje će omogućiti preciznije razumijevanje morfoloških, bioloških i fizioloških procesa kultiviranih biljaka, osobito pod utjecajem abiotičkog i biotičkog stresa uzrokovanog klimatskim promjenama. U skladu s navedenim ciljem djelatnici laboratorija bave se proučavanjem mineralnog sastava i biokemijskog profila istraživanih vrsta povrća i voća. Tijekom 2019. godine uveden je niz metoda za analize bioaktivnih spojeva (određivanje profila šećera, organskih kiselina i fenola HPLC tehnikom te ukupnih glukozinolata, ukupnih fenola, antioksidacijske aktivnosti (ORAC, DPPH i FRAP) spektrofotometrijski). U laboratoriju su uspostavljeni i sustavi za proučavanje fizioloških parametara povezanih s fotosintezom i vodnim odnosima u biljci te sustavi za proučavanje morfoloških svojstava nadzemnih i podzemnih organa biljke (lista, korijena, ploda i sjemena).

Djelatnici u laboratoriju provode analize za potrebe znanstvenih i stručnih projekata koji se odvijaju u Institutu te se planira uvođenje komercijalnih analiza u skladu sa zahtjevima tržišta. Oprema nabavljena kroz CroPBioDiv je novije generacije i omogućava fenotipizaciju biljaka baziranu na analitičkim tehnikama visoke propusnosti (ICP-OES, TOC/TN) i sustavima za mjerenje morfoloških i fizioloških svojstava biljke (npr. LI-COR 6800, LI-3000C LA Meter). Nadalje, korištenjem drugih izvora financiranja nabavljeni su HPLC sustav, čitač mikrotitarskih pločica, klima komora, penetrometar te sustav za fenotipizaciju.